生物发酵罐是一组生物体生长繁殖的过程，培养基是为微生物和细胞的生长繁殖以恒定速率制备的一组营养物质。正确的培养基配比是通过不断实践、调整和改进选择的正确组合，其基本成分由碳源、氮源、无机盐等组成。有必要清楚地说明酶学培养基的理化性质和制备方法。培养基制备后的灭菌方法必须是加热灭菌或过滤灭菌。还应说明配料罐的尺寸和搅拌方式。影响发酵工程过程的主要因素有：
1、温度对生物发酵罐的影响。
影响微生物和细胞生长发育的主要因素之一主要是温度。适中的温度是培养大多数微生物和细胞的必要条件。因此，一般需要控制发酵液的温度。培养过程根据品种和生长阶段，尽可能控制生物发酵罐内的温度，选择更合适的培养温度，以确保发酵过程顺利进行。
2、pH值对发酵工程的影响
发酵液的pH值直接影响微生物和细胞的生长繁殖。发酵工程培养基类型和微生物和细胞代谢影响发酵液的pH值必须时刻调节和控制发酵液的pH值，以保证生物发酵罐的正常运行。有很多方法可以通过直接添加酸和碱、选择合适的培养基或添加不影响发酵的缓冲液来进行调整。
3、气泡对发酵工程的影响
在发酵项目中，大量的气液混合物被引入到培养基中，因此发酵过程中容易因曝气和机械搅拌而产生气泡。产生大量泡沫不仅会降低填充率，逃出生物发酵罐，也改变了发酵液，从排气管或轴封处降低了相应的动力和曝气效果，抑制了生物体的生长和繁殖。以生物代谢过程产生的无菌空气和气体为分散相，培养连续相形成的气泡可以通过机械方式或加入化学消泡剂去除。
生物发酵后，有些生物发酵罐收集发酵液的上清液，有些则收集固体。无论是收集液体发酵还是固体发酵，都需要进行固液分离。发酵工程中常用的方法有离心、板框过滤、圆盘过滤和膜分离等。可根据发酵液的粘度、固形物、菌丝形态等物理性质选择合适的分离方法，为下一步的提取和纯化准备。
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